Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLDN2P57739 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLDN2P57739 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLDN2P57739 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLDN2P57739 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms