Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSCP56915 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSCP56915 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSCP56915 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms