Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CLDN6P56747 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLDN6P56747 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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