Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms