Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LIMK2P53671 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms