Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CRIP1P50238 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms