Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FNTBP49356 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FNTBP49356 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms