Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZEB1P37275 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms