Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXC8P31273 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms