Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ECHS1P30084 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms