Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHB2P29323 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms