Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SSFA2P28290 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SSFA2P28290 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms