Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DNMT1P26358 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms