Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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