Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GM2AP17900 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GM2AP17900 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GM2AP17900 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GM2AP17900 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GM2AP17900 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GM2AP17900 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GM2AP17900 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GM2AP17900 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GM2AP17900 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms