Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-EP13747 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms