Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SFTPCP11686 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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