Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GLI2P10070 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
GLI2P10070 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLI2P10070 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GLI2P10070 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GLI2P10070 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms