Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBX6O95503 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CBX6O95503 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms