Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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SCN2BO60939 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SCN2BO60939 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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