Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ITM2AO43736 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ITM2AO43736 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ITM2AO43736 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ITM2AO43736 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms