Protein–RNA interactions for Protein: O15417

TNRC18, Trinucleotide repeat-containing gene 18 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC18O15417 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNRC18O15417 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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