Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
USP9YO00507 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
USP9YO00507 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
USP9YO00507 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
USP9YO00507 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms