Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP29-1A8MX34 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms