Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB13A6NJU9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms