Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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