Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9Y3F1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9Y3F1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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