Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC12A4Q9UP95 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms