Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
L1RE1Q9UN81 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
L1RE1Q9UN81 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms