Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCDHA12Q9UN75 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PCDHA12Q9UN75 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms