Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMPRSS11EQ9UL52 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms