Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ABCF2Q9UG63 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ABCF2Q9UG63 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms