Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CGGBP1Q9UFW8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CGGBP1Q9UFW8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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