Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
REREQ9P2R6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms