Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SCHIP1Q9P0W5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms