Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
COX16Q9P0S2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COX16Q9P0S2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms