Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARHGEF38Q9NXL2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF38Q9NXL2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF38Q9NXL2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF38Q9NXL2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF38Q9NXL2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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ARHGEF38Q9NXL2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ARHGEF38Q9NXL2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARHGEF38Q9NXL2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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