Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTLNQ9NXG0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTLNQ9NXG0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms