Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SALL1Q9NSC2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SALL1Q9NSC2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms