Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPHK2Q9NRA0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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