Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms