Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ELL3Q9HB65 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ELL3Q9HB65 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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