Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ZYG11BQ9C0D3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms