Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIFKQ9BYG3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms