Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC4A5Q9BY07 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms