Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEMA3CQ99985 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEMA3CQ99985 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms