Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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CDRT15Q96T59 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CDRT15Q96T59 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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CDRT15Q96T59 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CDRT15Q96T59 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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