Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG3Q96JB2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG3Q96JB2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms