Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG2BQ96BY7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms