Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GTF3C6Q969F1 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GTF3C6Q969F1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GTF3C6Q969F1 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GTF3C6Q969F1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
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GTF3C6Q969F1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GTF3C6Q969F1 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GTF3C6Q969F1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GTF3C6Q969F1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GTF3C6Q969F1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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GTF3C6Q969F1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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GTF3C6Q969F1 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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